1998年的《X档案》第六季展开了一段令人震惊的剧情。在前一部电影《The Fall of the House of Rappaccini》（FTF）中逃离的一个基因技术研究公司的员工体内孵化出的变种外星生物，引发了一系列神秘事件。福奇博士（Gibson）成为关键线索的关键人物，他引导Mulder追查这一谜团，而Scully则利用她的科学知识，发现了一些令人不安的事实：所有的生命体都可能是“异形”的变种。随着剧情的发展，《X档案》的调查由之前的团队转交到了Spender和Fowley手中，两位新主管接手后，案件变得更加扑朔迷离。然而，在一系列复杂且危险的任务中，Gibson再次神秘失踪，留下了一个个未解之谜，使Mulder和Scully不得不重新评估他们对现实的理解，而X档案的世界也因此陷入了一片混乱与未知之中。
